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基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

發(fā)布時(shí)間:2024/10/24 10:40:05 發(fā)布廠商:武漢光量科技有限公司 >> 進(jìn)入該公司展臺(tái)



在眼科疾病的診斷領(lǐng)域,光學(xué)相干層析成像(OCT)光學(xué)相干層析血管成像(OCTA)是兩種非常重要的技術(shù)手段。然而,在成像過程中,由于成像對(duì)象的呼吸、心跳等非運(yùn)動(dòng),常常會(huì)產(chǎn)生運(yùn)動(dòng)偽影,嚴(yán)重影響了成像質(zhì)量。


北京理工大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)的鐘浩哲團(tuán)隊(duì)提出一種基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息來估計(jì)成像對(duì)象運(yùn)動(dòng)曲線進(jìn)而實(shí)現(xiàn)運(yùn)動(dòng)偽影校正的方法。利用所提方法分別對(duì)角膜的C-scan以及虹膜的OCTA圖像進(jìn)行分析,從而獲得慢軸方向上的相對(duì)運(yùn)動(dòng),并將二者結(jié)合得到準(zhǔn)確的運(yùn)動(dòng)曲線,并以此為參照校正OCT圖像中的運(yùn)動(dòng)偽影。


OCT和OCTA成像技術(shù)簡介


1.OCT成像原理

OCT是一種非侵入式光學(xué)成像手段,*早由Huang等人在 1991年提出。它的基本原理是將一束近紅外光分成兩束,一束照射在待測(cè)組織上并收集背向散射光,另一束射入?yún)⒖急鄄⑹占瓷涔?。利用近紅外光的相干性讓兩束光發(fā)生干涉,從而得到干涉光譜,再經(jīng)過一系列處理*終獲得樣本內(nèi)部的一維深度信息(A-scan)。通過在快軸方向上連續(xù)采集A-scan就可以獲得生物組織斷層圖像(B-scan),而在慢軸方向上連續(xù)采集B-scan則是三維光學(xué)相干層析成像(3D-OCT),在同一深度上的掃描結(jié)果被稱為C-scan。


2.OCTA成像原理

OCTA是一種無創(chuàng)的血管成像技術(shù),它在同一成像位置進(jìn)行多次B-scan掃描,并利用算法獲得斷層血流圖像。


運(yùn)動(dòng)偽影問題及其影響


1.運(yùn)動(dòng)偽影產(chǎn)生的原因

在OCT和OCTA成像過程中,成像對(duì)象在數(shù)據(jù)采集時(shí)發(fā)生移動(dòng),但在圖像重建過程中卻被錯(cuò)誤假定為靜止?fàn)顟B(tài),這就導(dǎo)致了*終輸出圖像中出現(xiàn)與成像組織不相干的失真影像,也就是運(yùn)動(dòng)偽影。


2.運(yùn)動(dòng)偽影對(duì)成像質(zhì)量的影響

運(yùn)動(dòng)偽影會(huì)導(dǎo)致OCT圖像質(zhì)量大幅下降,還可能引起臨床上對(duì)圖像的錯(cuò)誤解釋。在3D-OCT中,運(yùn)動(dòng)偽影通常表現(xiàn)為慢軸方向上的圖像不連貫及斷層。而且不同的OCT模式中,運(yùn)動(dòng)偽影出現(xiàn)的概率也有所不同。


例如,頻域OCT(FDOCT)的B-scan掃描速率較快,所以生物體非運(yùn)動(dòng)引起的B-scan失真比較小。但在進(jìn)行3D-OCT采樣時(shí),由于沿慢軸方向收集大量的B-scan需要較長時(shí)間,所以樣本運(yùn)動(dòng)對(duì)圖像的影響不可忽略。而OCTA掃描所需時(shí)間數(shù)倍于3D-OCT掃描,因此運(yùn)動(dòng)偽影出現(xiàn)的頻率更高。


3.現(xiàn)有校正方法及其局限性

硬件方案:包括基于眼動(dòng)追蹤儀等設(shè)備捕捉受試者的運(yùn)動(dòng)來輔助消除偽影,以及利用掃描激光檢眼鏡對(duì)眼底采樣并與3D-OCT圖像互補(bǔ)校正偽影等。


軟件方案:例如基于粒子濾波的方法、基于C-scan像素行的相關(guān)性匹配算法以及利用3D-OCT掃描體分割引導(dǎo)配準(zhǔn)原理消除運(yùn)動(dòng)偽影等。


局限性:目前大多數(shù)研究只關(guān)注眼底的OCT掃描成像過程中的偽影校正,很少討論眼前節(jié)3D-OCT中同樣存在的運(yùn)動(dòng)偽影問題,而眼前節(jié)的成像質(zhì)量對(duì)于眼科疾病診斷同樣至關(guān)重要。


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的校正方法


1.理論依據(jù)

研究人員發(fā)現(xiàn)人和動(dòng)物的角膜普遍呈現(xiàn)光滑的類半球形,其理想條件下的C-scan圖像的輪廓呈圓形,并且眼虹膜上的血管分布也是連續(xù)變化的。由于3D-OCT掃描中B-scan之間的距離很小,并且生物組織內(nèi)部結(jié)構(gòu)都是緩慢連續(xù)變化的,所以相鄰B-scan之間存在較高的相關(guān)性。而運(yùn)動(dòng)偽影的成因本質(zhì)上是相鄰B-scan之間的相對(duì)移動(dòng),因此可以通過互相關(guān)函數(shù)來計(jì)算它們的相對(duì)位移。

2.互相關(guān)函數(shù)計(jì)算方式

互相關(guān)算法是一種常用的信號(hào)處理技術(shù)。對(duì)于兩個(gè)存在相關(guān)性的連續(xù)實(shí)序列信號(hào),其互相關(guān)函數(shù)的計(jì)算公式為< height="5.553ex" src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_svg/wcib2GksmGOnjOickNFUUicE8N90rGLZMMibGWfD6OtjWDLNGMaO735Ttlia7vLSdbcicNUMHq9P2phs7B4s1bCNyJ5jC2ciacFA1DD/0?wx_fmt=svg&from=appmsg" style="width:33.97ex;height:5.553ex;" width="33.97ex" />。通過改變實(shí)序列的偏移量并求取兩個(gè)序列在域上的積分,就可以得到二者的互相關(guān)函數(shù)。當(dāng)互相關(guān)函數(shù)出現(xiàn)峰值時(shí),意味著兩個(gè)序列在偏移點(diǎn)處具有*相關(guān)性。


3.運(yùn)動(dòng)曲線估算流程與圖像校正方法

1>流程

首先將C-scan圖像或OCTA圖像沿慢軸掃描方向進(jìn)行逐行分離,將每一個(gè)像素行定義為待對(duì)齊序列,參考序列作為對(duì)齊基準(zhǔn)。將待對(duì)齊序列與參考序列進(jìn)行互相關(guān)運(yùn)算,得到平移量,再根據(jù)平移量對(duì)該序列進(jìn)行平移操作,得到校正后的序列。為了提升算法對(duì)圖像噪聲干擾的穩(wěn)健性,可以將此前已校正的若干序列的平均序列作為參考序列。


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

偏移量估計(jì)及運(yùn)動(dòng)偽影校正流程圖


然后計(jì)算該參考序列與待校正的下一個(gè)序列的互相關(guān)函數(shù),通過自相關(guān)函數(shù)峰值的位置得到相對(duì)偏移量。*根據(jù)相對(duì)偏移量將待校正的序列進(jìn)行平移,與此前已校正的序列對(duì)齊,從而實(shí)現(xiàn)運(yùn)動(dòng)偽影校正。依次重復(fù)此操作,直到獲得所有行之間的平移量所組成的運(yùn)動(dòng)曲線,同時(shí)也得到了校正后的圖像。


2)預(yù)處理

對(duì)C-scan圖像進(jìn)行兩項(xiàng)預(yù)處理:采用高斯濾波來降低圖像的噪聲;將圖像與Sobel算子進(jìn)行卷積運(yùn)算,提取角膜的邊緣輪廓。這樣可以使處理后的C-scan圖像的每行數(shù)據(jù)由寬峰變?yōu)檎?,提高互相關(guān)算法提取運(yùn)動(dòng)曲線的準(zhǔn)確性。而OCTA圖像由于其中的血管為細(xì)小的線條,無需進(jìn)行邊緣增強(qiáng),可直接利用互相關(guān)方法提取運(yùn)動(dòng)曲線。


4.與其他方法的比較

研究人員還提供了兩種方法進(jìn)行對(duì)比。一種方法是僅使用眼前節(jié)的C-scan圖像執(zhí)行運(yùn)動(dòng)曲線估算流程(方法1),另一種方法是僅使用眼虹膜的OCTA圖像執(zhí)行運(yùn)動(dòng)曲線估算流程(方法2)。而所提方法(方法3)則是先對(duì)采自同次3D-OCT及OCTA掃描的眼前節(jié)C-scan和眼虹膜OCTA圖像執(zhí)行運(yùn)動(dòng)曲線估算流程,然后將C-scan曲線的中間部分以及OCTA曲線的前后部分進(jìn)行拼接,得到完整且準(zhǔn)確的運(yùn)動(dòng)曲線。


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

眼前節(jié)C-scan的圖像預(yù)處理流程


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

三種方法的具體流程


實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證


1.實(shí)驗(yàn)對(duì)象及數(shù)據(jù)采集

實(shí)驗(yàn)采用健康的活體昆明小鼠,在采樣前通過腹腔注射10%水合氯醛來麻醉小鼠,避免其運(yùn)動(dòng)對(duì)采樣造成影響。用于數(shù)據(jù)采集的是實(shí)驗(yàn)室自制的SD-OCT設(shè)備,其光源為860nm中心波長、約100nm帶寬的輻射發(fā)光二極管。


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

用于數(shù)據(jù)采集的自制SDOCT系統(tǒng)示意圖


A-line線掃描速度可達(dá)120kHz,空氣中成像深度約為2.4mm,橫向分辨率和縱向分辨率分別約為14μm和5μm。在3D-OCT掃描中,三維體數(shù)據(jù)由550幅B-scan圖像組成,每幅B-scan圖像又由550幅A-scan圖像組成。在OCTA模式下,在每個(gè)位置重復(fù)掃描3次,*終得到的數(shù)據(jù)點(diǎn)數(shù)為< height="2.185ex" src="https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_svg/wcib2GksmGOnjOickNFUUicE8N90rGLZMMibvGWZm385bBPribiaRwWcdTIudrh4EYDOyqibFcJJJufbu6P3MgOSdcbIRh3RpU2nQzy/0?wx_fmt=svg&from=appmsg" style="width:32.036ex;height:2.185ex;" width="32.036ex" />,每次OCTA的采集時(shí)間約為11.3s。

2.運(yùn)動(dòng)偽影校正結(jié)果及比較分析

1>運(yùn)動(dòng)曲線比較

  • 方法1所提取的運(yùn)動(dòng)曲線僅在中間部分體現(xiàn)出生物呼吸節(jié)律,兩端趨于平坦。

  • 方法2所提取的運(yùn)動(dòng)曲線在兩端體現(xiàn)出生物呼吸節(jié)律,而在中間部分出現(xiàn)斷崖式下降。

  • 所提方法(方法3)通過截取和拼接將前兩者的有用信息結(jié)合在一起,得到完整的運(yùn)動(dòng)曲線,符合小鼠呼吸規(guī)律。


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

三種方法所使用的運(yùn)動(dòng)曲線


2>圖像校正效果比較

  • 原始的角膜C-scan圖像中角膜輪廓呈現(xiàn)出鋸齒狀偽影,虹膜OCTA圖像中的血管也出現(xiàn)非正常的鋸齒形。

  • 方法1校正角膜中段約1/3區(qū)域的運(yùn)動(dòng)偽影,但上下各約1/3區(qū)域處的運(yùn)動(dòng)偽影仍然存在。使用方法1校正的OCTA圖像也存在相同問題。

  • 方法2校正上下各約1/3區(qū)域的運(yùn)動(dòng)偽影,但中段約1/3區(qū)域被引入較大的偏差。其原因是虹膜中部的血管為水平分布,豎向相關(guān)性較差。

  • 所提方法校正效果理想,角膜C-scan圖像中花邊形的邊緣被還原為光滑的圓,虹膜OCTA圖像的微血管網(wǎng)絡(luò)中鋸齒狀偽影被修復(fù),enface圖像中波紋樣偽影被消除。


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

原始的眼前節(jié)C-scan圖像與3種方法校正后的眼前節(jié)C-scan圖像對(duì)比(紅箭頭:運(yùn)動(dòng)偽影)。(a)校正前的邊緣增強(qiáng)C-scan圖像;(b)~(d)3種方法校正后的邊緣增強(qiáng)C-scan圖像


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

原始的虹膜OCTA圖像與3種方法校正后的虹膜OCTA圖像對(duì)比(紅箭頭:運(yùn)動(dòng)偽影或偏移)。(a)校正前的虹膜OCTA圖像;(b)~(d) 3種方法校正后的虹膜OCTA圖像


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

原始的虹膜enface圖像與3種方法校正后的虹膜enface圖對(duì)比(紅箭頭:運(yùn)動(dòng)偽影)。(a)校正前的虹膜enface圖像;(b)~(d)用3種方法校正后的虹膜enface圖像


基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正

眼前節(jié)的OCT(灰度)和OCTA(紅色)的三維渲染圖(紅箭頭:運(yùn)動(dòng)偽影)。(a)校正前;(b)利用所提出方法校正后


方法的優(yōu)勢(shì)與局限性


1.優(yōu)勢(shì)

  • 所提方法的計(jì)算量小且無需引入額外硬件設(shè)備和冗余掃描方式,能夠滿足眼前節(jié)運(yùn)動(dòng)偽影校正的需要,降低了系統(tǒng)的搭建成本以及數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)的復(fù)雜程度。

  • 對(duì)于具有規(guī)則、對(duì)稱結(jié)構(gòu)的生物組織具有較好的適用性,能夠有效地還原眼前節(jié)的真實(shí)結(jié)構(gòu),如光滑的圓形角膜邊緣以及筆直、連續(xù)的虹膜微血管網(wǎng)絡(luò)。

  • 所提方法中基于生物組織固有結(jié)構(gòu)信息的偽影去除思路可以擴(kuò)展到其他生物醫(yī)學(xué)成像應(yīng)用中。

2.局限性

  • 所提方法僅對(duì)平行于快軸方向的運(yùn)動(dòng)進(jìn)行校正,忽略了沿著光傳播方向的運(yùn)動(dòng)對(duì)成像造成的影響,未來可進(jìn)一步研究對(duì)沿光傳播方向運(yùn)動(dòng)的校正。

  • 對(duì)于結(jié)構(gòu)不規(guī)則的生物組織難以實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確的偽影校正。


結(jié)與展望


研究人員提出了一種基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT及OCTA的運(yùn)動(dòng)偽影去除方法。該方法無需添加額外硬件,基于眼前節(jié)中角膜以及虹膜血管的固有結(jié)構(gòu)信息,通過互相關(guān)算法估計(jì)運(yùn)動(dòng)曲線并對(duì)運(yùn)動(dòng)造成的偽影及偏移進(jìn)行校正。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方法能夠有效處理由呼吸等運(yùn)動(dòng)引起的運(yùn)動(dòng)偏移,是一種低成本且有效的偽影校正方法,對(duì)提升眼前節(jié)3D-OCT及OCTA掃描效果具有重要意義。


聲明:本文僅用作學(xué)術(shù)目的。文章來源于:鐘浩哲, 曹良齊, 張曉. 基于眼前節(jié)結(jié)構(gòu)信息的OCT和OCTA圖像運(yùn)動(dòng)偽影校正[J]. 光學(xué)學(xué)報(bào), 2024, 44(19): 1917001. Haozhe Zhong, Liangqi Cao, Xiao Zhang. Structural-Information-Based Motion Artifact Correction for OCT and OCTA Images of Anterior Segments[J]. Acta Optica Sinica, 2024, 44(19): 1917001.



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